新型コロナウイルス変異株解析:ゲノム配列解析による系統解析(型判別)
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新型コロナウイルス変異株解析
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新型コロナウイルス ゲノム配列解析による系統解析
Tentamus Japanは、2021年3月22日より、新型コロナウイルス陽性検体を対象とした変異株解析の受託を開始致します。 新型コロナウイルスは、変異により感染を増大させる懸念を有する変異を持つ新規変異株、免疫逃避型の変異を持つ変異株などが市中で検出され、変異株の迅速な検査の必要性が急速に高まっています。変異株の型解析は、従来のPCR検査ではなく、ウイルスの全ゲノム配列の解析による型判別が必要となります。 Tentamus Japanは、次世代シーケンサーによる新型コロナウイルスの全ゲノム長の網羅的配列解析を行い、得られた配列データを国際新型コロナウイルス配列データベースと照合する事で、型解析を行います。
検査の種類:新型コロナウイルスの全ゲノム長由来配列の網羅的解析による系統解析(型判別)
- 陽性検体より抽出されたRNAのゲノム全長をマルチプレックスPCRで増幅
- 次世代シーケンサーにより網羅的にゲノム配列を解析
- 得られた配列データと国際新型コロナウイルス系統データベースを照合する事で、新型コロナウイルス系統を判別
- 変異株解析の詳細につきましては、下記よりご照会ください。
- 検査所要時間:5-11日(通常5日、再解析実施時には11日程度を要します)
- 本変異株解析は、医療機関、行政機関、検査機関等の専門機関よりの受託となります。 一般個人、企業よりの受託はできません。
分析検査料金 | 検査法 | 料金/検体 | 注記 | ||
新型コロナウイルス系統解析 | RNAサンプル検体の場合 | NGS シーケンス解析 | 25,000円(税別) (27,500円税込) |
検体毎 | |
唾液・鼻咽頭拭い液検体(COVID-19陽性) | NGSシーケンス解析 | 27,000円(税別) (29,700円税込) |
検体毎 | ||
備考 ・新型コロナウイルス陽性検体のRT-PCR検査においてCt値30以下の検体を推奨 ・多検体を解析する場合は、別途ご相談ください。 ・Ct値30以上の検体は、ウイルス量が少なく、解析ができない場合があります。 特にCt値35以上の検体は、シーケンス解析による系統解析が困難です。 |
新型コロナウイルス変異株解析の結果
- 新型コロナウイルス系統解析結果
- シーケンスデータ(系統解析結果に加えて必要な場合、データにて提供)
Tentamus Japanは、登録衛生検査所として、2020年度 新型頃ウイルス(SARS-CoV-2)RNA 外部精度管理調査にも参加し定性・定量検査ともにSDI値±2以内と適正な調査結果を得ています。今後も、内部・外部精度管理の向上に取り組んで行きます。